LabDAO чертае бъдещето на AI с отворен код за откриване на лекарства

Проектът Folding@home нашумя по време на пандемията от COVID-19 за мобилизиране на неизползвана изчислителна мощност за изследване на пространството за търсене на сгъване на протеини за справяне с новия коронавирус. Давайки възможност на гражданите да бъдат учени сами по себе си, инициативата проведе широкомащабни симулации на различни молекулярни конфигурации на протеини в разпределена мрежа от „записани“ компютри по целия свят.

Тази децентрализирана парадигма беше обявена за обединяване на хората около общ проблем и ефективно набиране на изчислителна мощност, но какво ще стане, ако изчислителната мощност и инфраструктурата за решаване на проблеми бяха обърнати? С други думи, какво ще стане, ако хората могат да управляват свои собствени проекти, като използват натрупаната изчислителна мощност намлява инструментите за биологични експерименти за зареждане?

LabDAO превръща тази мечта в реалност със своята платформа PLEX. PLEX е инструмент за команден ред с отворен код, предназначен да направи достъпни не само изчислителни ресурси, но и различни инструменти за обучение на биологични машини (създадени като пакет „BioML“ в LabDAO) в различни среди. Независимо дали експериментирате с докинг на малки молекули или собствени симулации на сгъване на протеини, PLEX позволява на потребителите да се докоснат до библиотеката от инструменти на LabDAO, да споделят резултати и да ги визуализират за по-малко от пет минути.

Този пакет от инструменти и неговата позволяваща използване платформа върху него бяха изложени на срещата на върха на Zuzalu Blockchain Meets Biology в началото на април, където членът на основния екип на LabDAO Лили Хансен-Гилис демонстрира от началото до края симулация на вътрешна молекулярна динамика на протеин, за да намери своята най-стабилна конфигурация. След това, като самопровъзгласил се „некодер“, тя преведе публиката през него от началото до края – всичко с компютър, WiFi, PLEX на командния ред и нищо повече.

В по-широк план LabDAO е децентрализирана платформа с активиран web3 (част от по-голямото движение „DeSci“), ангажирана със създаването на по-продуктивна среда за откриване на лекарства с отворен код. Като предоставя най-новите инструменти и ресурси за по-широка екосистема, LabDAO има за цел да създаде правилната среда за прозрачни и достъпни научни постижения. Независимо дали чрез елиминиране на необходимостта изследователите да имат собствен хардуер или изчислителна инфраструктура или чрез публикуване на резултати от експерименти в блокчейн книга, така че да са проследими и възпроизводими, организацията се ангажира да направи повече иновации възможни чрез сътрудничество - разрушаване на бариерите, причинени от лошо използваемост и силосирана, нишова експертиза.

Усилията на LabDAO да изгради този свят на бъдещето на DeSci за днес наскоро получиха тласък под формата на кръг от $3.6 милиона финансиране от различни други DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan и други. Този приток на подкрепа ще допринесе за продължаващите усилия за изграждане на софтуерни инструменти с отворен код и за укрепване на изследователската екосистема на LabDAO.

Що се отнася до самия PLEX, непосредствените следващи стъпки на хоризонта включват тестване на платформата в различни научни сътрудничества, контейнеризиране на различни инструменти и натрупване на необходимия хардуер за насърчаване на мрежата BioML.

Що се отнася до дългосрочен план, може би следващото животоспасяващо лекарство по време на следващото голямо огнище на инфекциозна болест ще бъде проектирано със силата на PLEX, една децентрализирана стъпка напред в даден момент. Тъй като екосистемата продължава да расте, само времето ще покаже.

Благодаря ви за Айшани Аатреш за допълнителни изследвания и докладване на тази статия. Аз съм основател на SynBioBeta и някои от компаниите, за които пиша, са спонсори на Конференция SynBioBeta. За повече съдържание можете да се абонирате за моят седмичен бюлетин.